Garantir flexibilidade do sistema em comunicação com banco de dados é de fundamental importância. Por isso, o GP.D foi desenvolvido sob o conceito de multiplataforma, eliminando a obrigatoriedade do uso do sistema junto a um determinado banco de dados, permitindo a integração com os mais diversos bancos, como Oracle, IBM-DB2, SQLServer, PostgreSQL.

Com isso é possível integrar o sistema a outras plataformas pré-existentes, permitir que a administração pública desenvolva sua infra-estrutura sem ficar presa a licenças de banco de dados e, sem repetir gastos em aquisição de sistemas por conta da substituição de plataformas de armazenamento. Com o GP.D, o município escolhe o banco de dados que deseja operar.

Em seu formato padrão, o GP.D se utiliza do banco de dados PostgreSQL, versão 8.4, um dos gerenciadores mais avançados do mundo. A recomendação ao uso desta plataforma se deve a sua robustez, segurança, capacidade e licença gratuita, permitindo que a administração pública tenha a garantia de um banco de dados forte e eficiente sem gastar por isso.